Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms