Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms