Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA3Q9UL41 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms