Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms