Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
MBD5Q9P267 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD5Q9P267 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms