Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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