Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms