Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms