Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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