Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms