Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms