Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms