Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms