Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP3Q96DZ5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms