Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms