Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms