Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms