Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms