Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms