Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLCA4Q14CN2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCA4Q14CN2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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