Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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