Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms