Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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CNGB1Q14028 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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CNGB1Q14028 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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CNGB1Q14028 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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CNGB1Q14028 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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