Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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