Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms