Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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