Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP4Q13115 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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