Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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