Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A2Q01362 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms