Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX1P48742 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX1P48742 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms