Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms