Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms