Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms