Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms