Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms