Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms