Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB9P17482 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms