Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXTL3O43909 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292 ms