Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms