Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms