Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms