Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms