Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms