Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2J1Q9Y385 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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