Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms