Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms