Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3Q9UJ98 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STAG3Q9UJ98 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms