Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms