Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CTSFQ9UBX1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CTSFQ9UBX1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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