Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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